97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3059 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 325 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  65.31 
 
 		 330 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.71 
 
 		 753 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  36.86 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.85 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.02 
 
 		 883 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.3 
 
 		 881 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.33 
 
 		 854 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.95 
 
 		 835 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.95 
 
 		 835 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.28 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.28 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.71 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.03 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.15 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.25 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  24.49 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.59 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  21.87 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  22.67 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.7 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.69 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.17 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.78 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.67 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.69 
 
 		 429 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  54.76 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  54.76 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  54.76 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.18 
 
 		 416 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  54.76 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  22.73 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  38.1 
 
 		 577 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.75 
 
 		 597 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.86 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  52.38 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  31.51 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  25.58 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  33.33 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.67 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  21.88 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.94 
 
 		 222 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.07 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.98 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  40.74 
 
 		 520 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  43.14 
 
 		 560 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  30.3 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  31.82 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2126  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.45 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.25 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0550  site-specific DNA-methyltransferase, putative  32.69 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.20676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  32.69 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.67 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.84 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  31.82 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.7 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  31.82 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.89 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.48 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  41.18 
 
 		 567 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.36 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  26.26 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  45 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.19 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.22 
 
 		 545 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  31.08 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  38.81 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  31.82 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.98 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.84 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.25 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.72 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  37.88 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  32.81 
 
 		 481 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.29 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  26.19 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.9 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  33.77 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 		 553 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  19 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 		 399 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  34.25 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.48 
 
 		 372 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  43.48 
 
 		 372 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  36.84 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  38.1 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.7 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4172  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 		 972 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.77 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  30.3 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.48 
 
 		 396 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>