67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0592 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0592  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000184153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0804  MerR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  41.1 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 123 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  38.46 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  29.13 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 281 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  31.94 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 272 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 292 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10940  putative transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.826856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 252 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 166 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3755  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0385  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 840 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  44.93 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  33.8 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3031  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.532106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0091  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  36.62 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  36.76 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  34.29 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  29.63 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 118 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 118 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 159 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  32.31 
 
 		 108 aa  42  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 137 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  32.39 
 
 		 109 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>