29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4670 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  69.06 
 
 
154 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  46.38 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  47.1 
 
 
141 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  52.14 
 
 
163 aa  126  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  35.56 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  36.5 
 
 
152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  36.5 
 
 
142 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  34.81 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  30.15 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  31.16 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  29.93 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  29.93 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  33.09 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  30.65 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  33.81 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  35.9 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  30.82 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  29.2 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  49.02 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  25.78 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  45.1 
 
 
191 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  26.92 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.94 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  26.02 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  29.73 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>