225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4337 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  961    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  60.55 
 
 
478 aa  546  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  57.93 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  58.12 
 
 
498 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  58.33 
 
 
498 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  59.33 
 
 
459 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  57.96 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  56.53 
 
 
479 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  54.91 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  54.72 
 
 
474 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  44.06 
 
 
473 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  44.06 
 
 
473 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  44.92 
 
 
475 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  42.83 
 
 
474 aa  351  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  44.14 
 
 
492 aa  343  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  42.39 
 
 
482 aa  342  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  39.75 
 
 
485 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  45.17 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  42.09 
 
 
475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  41.27 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.98 
 
 
486 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  37.6 
 
 
508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  35.92 
 
 
486 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.06 
 
 
540 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  37.23 
 
 
486 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  35.89 
 
 
489 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  34.58 
 
 
484 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  34.58 
 
 
484 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  34.58 
 
 
484 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  43.61 
 
 
492 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  38.54 
 
 
473 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  36.27 
 
 
485 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  35.31 
 
 
481 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  38.77 
 
 
494 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  36.52 
 
 
483 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  35.53 
 
 
481 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  35.53 
 
 
481 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  35.43 
 
 
491 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  34.79 
 
 
489 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  39.12 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  39.9 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  36.56 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  35.28 
 
 
496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  38.3 
 
 
459 aa  213  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  38.48 
 
 
482 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  39.68 
 
 
492 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  37.6 
 
 
483 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  34.51 
 
 
485 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  37.75 
 
 
480 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  36.52 
 
 
483 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  35.24 
 
 
484 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  36.76 
 
 
480 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  40.07 
 
 
480 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  39.74 
 
 
480 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  38.77 
 
 
491 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  36.86 
 
 
484 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  35.03 
 
 
483 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  36.49 
 
 
492 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  35.71 
 
 
487 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  39.61 
 
 
481 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  39.74 
 
 
480 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  37.83 
 
 
478 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  39.74 
 
 
480 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  39.66 
 
 
548 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  39.02 
 
 
491 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  40.33 
 
 
481 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  38.28 
 
 
478 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  38.28 
 
 
478 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  37.06 
 
 
472 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  35.5 
 
 
504 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  42.14 
 
 
491 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  35.06 
 
 
483 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  39.17 
 
 
481 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  34.56 
 
 
505 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  35.98 
 
 
491 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  38.08 
 
 
491 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  34.69 
 
 
480 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  40.33 
 
 
502 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  34.29 
 
 
497 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  39.1 
 
 
486 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  34.06 
 
 
498 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  35.77 
 
 
503 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  37.5 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  37.25 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  41.28 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  37.5 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  34.6 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  41.81 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  40.78 
 
 
498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  37.17 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  35.01 
 
 
497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  37.39 
 
 
521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  37.17 
 
 
478 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  34.17 
 
 
522 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  39.22 
 
 
512 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  37.17 
 
 
478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  37.17 
 
 
478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  33.5 
 
 
488 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  34.28 
 
 
487 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  34.28 
 
 
483 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>