More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3379 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 414 aa  837    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.66 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.66 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.84 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.52 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.17 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.09 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.52 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.57 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.83 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.96 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.46 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.57 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.65 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.57 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.61 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.22 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.39 
 
 		 420 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.04 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.48 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.64 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.82 
 
 		 430 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.87 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.2 
 
 		 419 aa  359  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.85 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.28 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.37 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.06 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.04 
 
 		 426 aa  355  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.21 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.65 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6062  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498795  normal  0.336807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.24 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.72 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.76 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.28 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.08 
 
 		 422 aa  349  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 422 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.48 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.69 
 
 		 425 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 		 427 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 423 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.76 
 
 		 704 aa  347  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.72 
 
 		 438 aa  346  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1392  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 420 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 422 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 420 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2459  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.44 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.27 
 
 		 449 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 		 591 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4024  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2467  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.4 
 
 		 420 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0419834  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.51 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 427 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.32 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.17 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.5 
 
 		 428 aa  342  9e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.84 
 
 		 428 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>