40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0258 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  100 
 
 
898 aa  1819    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  42.82 
 
 
584 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  44.1 
 
 
586 aa  247  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  42.99 
 
 
584 aa  233  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  42.33 
 
 
576 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  40.06 
 
 
586 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  40.06 
 
 
625 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  40.76 
 
 
579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  38.58 
 
 
631 aa  212  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  38.48 
 
 
613 aa  205  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  39.94 
 
 
612 aa  203  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  35.65 
 
 
598 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  36.36 
 
 
799 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  39.94 
 
 
612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  39.41 
 
 
580 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  33.96 
 
 
780 aa  185  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  35.65 
 
 
610 aa  184  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  35.6 
 
 
586 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  33.43 
 
 
632 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  35.14 
 
 
924 aa  171  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  36.39 
 
 
892 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  32.53 
 
 
643 aa  152  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  34.06 
 
 
1392 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  30.61 
 
 
832 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  30.15 
 
 
801 aa  135  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  28.13 
 
 
827 aa  132  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  39.66 
 
 
837 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  40 
 
 
739 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  39.88 
 
 
808 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  27.25 
 
 
802 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  28.03 
 
 
996 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  33.33 
 
 
672 aa  104  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  29.8 
 
 
985 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  35.45 
 
 
796 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  34.15 
 
 
644 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  30.43 
 
 
682 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  31.49 
 
 
951 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
554 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  40 
 
 
713 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  37.37 
 
 
682 aa  45.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>