77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1534 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  67.91 
 
 
322 aa  360  9e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  63.56 
 
 
288 aa  315  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  62.7 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  62.45 
 
 
300 aa  296  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  34.11 
 
 
308 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  43.26 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  40.38 
 
 
318 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  37.18 
 
 
300 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  38.12 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  36.84 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  31.91 
 
 
310 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  36.84 
 
 
183 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  30.57 
 
 
299 aa  86.3  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  30.38 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  29.86 
 
 
288 aa  81.6  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  28.19 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  45.95 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  43.36 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  26.42 
 
 
309 aa  79  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  90.48 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  92.86 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  29.18 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  28.14 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  27.41 
 
 
334 aa  72  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1913  hypothetical protein  83.72 
 
 
79 aa  72  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  30.15 
 
 
326 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  30.15 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  80.95 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  30.15 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  81.4 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  28.07 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  33.94 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  26.6 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  24.53 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  37.84 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  25.89 
 
 
330 aa  65.1  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  23.48 
 
 
317 aa  64.3  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  22.78 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  22.46 
 
 
302 aa  63.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  22.54 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  25.96 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  24.15 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  26.5 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  26.32 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  28.37 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  22.59 
 
 
305 aa  58.9  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  29.15 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  25.62 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  25.58 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  22.41 
 
 
326 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  23.08 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  22.52 
 
 
326 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.7 
 
 
306 aa  55.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  23.15 
 
 
313 aa  52.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  25.45 
 
 
401 aa  52  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  25.45 
 
 
384 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  24.43 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  30.77 
 
 
324 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  20.94 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  20.87 
 
 
303 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  23.95 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  23.01 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  21.46 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  22.67 
 
 
311 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  23.87 
 
 
296 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  20.94 
 
 
308 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0551  hypothetical protein  30.51 
 
 
166 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298634  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  23.14 
 
 
285 aa  45.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  23.56 
 
 
288 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  21.98 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0917  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase Gid  25.71 
 
 
438 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0255026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  19.92 
 
 
325 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  20.51 
 
 
307 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>