More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9054 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  47.67 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  56.76 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  43.68 
 
 
115 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  52.7 
 
 
71 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  48.1 
 
 
77 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  48.1 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  49.3 
 
 
214 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  43.9 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  54.93 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  49.3 
 
 
206 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  46.67 
 
 
75 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  44 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  42.2 
 
 
98 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50.65 
 
 
75 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  42.42 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  47.95 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  40.37 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  45.45 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  47.3 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2086  hypothetical protein  54.84 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  44.44 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  52.11 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  45.33 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  47.5 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  46.25 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
80 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  46.67 
 
 
72 aa  78.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  45.45 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  43.75 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  45.83 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  45.83 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.41 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50.7 
 
 
69 aa  77  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  43.59 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  45.07 
 
 
79 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 
77 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  43.48 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  44 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  44.16 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  35.56 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.11 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  43.48 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  41.56 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  54.29 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  45.95 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  43.48 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  43.48 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  49.3 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  34.96 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  41.77 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  39.42 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  49.3 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  47.89 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  49.3 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  46.38 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  42.39 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  34.96 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  47.89 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  42.39 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  45 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  42.39 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  41.24 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  45.68 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  45.07 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  48.61 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  51.52 
 
 
64 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>