More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9043 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  71.3 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  63.89 
 
 		 108 aa  156  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  67.96 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  66.99 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  62.62 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  67.65 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  63.21 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  61.32 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  63.21 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  57.94 
 
 		 107 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  59.41 
 
 		 106 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.94 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  63.11 
 
 		 109 aa  137  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  60.75 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.94 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  55.66 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  61.76 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  58.25 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  57.01 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  133  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  133  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  55.14 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  63.92 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  58.49 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  57.43 
 
 		 107 aa  129  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  57.73 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  58.16 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  58.82 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  54.46 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  55.45 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.55 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  54.81 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  55.77 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  59.14 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  56.25 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  56.57 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  61.05 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  56.25 
 
 		 106 aa  121  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  56.25 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  55.67 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  55.88 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52.08 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  54.08 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  56.25 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.48 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  51.49 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  50.52 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  55.21 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.08 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  49 
 
 		 259 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  48.08 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  52.58 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  53.12 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  54.08 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  52.08 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  47.12 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  53.4 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  55.21 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  52.08 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  52.08 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  56.25 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  48.96 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  48.96 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  52.08 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  48.96 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  48.96 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  50 
 
 		 259 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>