31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4601 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  351  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  53.53 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  52.76 
 
 		 171 aa  190  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  51.18 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  50 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  52.05 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  49.4 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  46.34 
 
 		 176 aa  163  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  39.88 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  48.03 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  28.36 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  31.13 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  31.53 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  26.04 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  27.11 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  34.04 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  34.04 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  29.07 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  33.33 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  29.3 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  26.32 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  29.77 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  30.21 
 
 		 969 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>