More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3822 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  100 
 
 
164 aa  343  8e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.4 
 
 
160 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  51.85 
 
 
137 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  35.97 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  36.15 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
181 aa  84.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  31.34 
 
 
171 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  35.11 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.2 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  31.3 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  28.12 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  30.61 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  35.2 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.07 
 
 
380 aa  74.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  29.29 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.17 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.43 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.34 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.91 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.86 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.23 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.65 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  30.56 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.73 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  25.76 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  29.66 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  26.39 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.21 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.21 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  35.51 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1961  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.93 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  28.19 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  33.98 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  33.98 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
433 aa  68.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.89 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  30.23 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  28.37 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.03 
 
 
378 aa  68.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0183  Redoxin domain protein  30.23 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.53 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  30.91 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  34.58 
 
 
332 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  34.58 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  34.62 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.24 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2287  putative thiol:disulfide interchange protein  30.17 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129752  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  34.58 
 
 
316 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.33 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  35 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.7 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  27.21 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  27.67 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  30.84 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  29.51 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  29.06 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.7 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.82 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.17 
 
 
409 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  32.06 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  29.06 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  29.06 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  29.06 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  23.2 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  31.15 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.53 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  28.78 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  28.23 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  34.58 
 
 
306 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  34.58 
 
 
306 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  28 
 
 
396 aa  64.7  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  30.15 
 
 
369 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  30.58 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  28.24 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  29.5 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
380 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.83 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  30.52 
 
 
306 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  28.26 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  34.86 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  34.86 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  28.68 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 
390 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  35.14 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>