More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0965 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  100 
 
 		 562 aa  1147    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  43.13 
 
 		 447 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 558 aa  339  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  44.92 
 
 		 734 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  44.6 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  43.03 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  39.46 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  43.72 
 
 		 435 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  43.72 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  43.78 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  43 
 
 		 435 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  40.33 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  39.15 
 
 		 464 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  39.24 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  38.77 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  28.7 
 
 		 513 aa  145  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  27.79 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  31.27 
 
 		 268 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  27.23 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  29.71 
 
 		 499 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  33.62 
 
 		 272 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  37.33 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  37.21 
 
 		 332 aa  126  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  34.93 
 
 		 278 aa  126  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.18 
 
 		 270 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  33.77 
 
 		 272 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  33.91 
 
 		 269 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32.46 
 
 		 271 aa  124  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  36 
 
 		 279 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.36 
 
 		 218 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  35.71 
 
 		 273 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  30.65 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  27.3 
 
 		 512 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  31.8 
 
 		 281 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.91 
 
 		 272 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.27 
 
 		 281 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  33.98 
 
 		 287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  33.91 
 
 		 274 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.5 
 
 		 299 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.65 
 
 		 285 aa  120  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  29.56 
 
 		 302 aa  120  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  31.14 
 
 		 272 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  36.32 
 
 		 270 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.47 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 290 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.73 
 
 		 283 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  27.8 
 
 		 273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  32.17 
 
 		 285 aa  115  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  30.43 
 
 		 281 aa  115  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  32.05 
 
 		 274 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  30.08 
 
 		 270 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  34.8 
 
 		 321 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  32.6 
 
 		 284 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 330 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  34.12 
 
 		 273 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  32.41 
 
 		 274 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.17 
 
 		 267 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  31.56 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  29.24 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  34.57 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.6 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  30.51 
 
 		 284 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.3 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  30.34 
 
 		 272 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  28.67 
 
 		 290 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  33.33 
 
 		 273 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 264 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.43 
 
 		 285 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  34.84 
 
 		 323 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 273 aa  107  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.65 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.31 
 
 		 269 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  33.18 
 
 		 284 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  32.18 
 
 		 274 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  32.84 
 
 		 278 aa  104  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  30.13 
 
 		 273 aa  104  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  28.99 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  32.09 
 
 		 272 aa  103  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  31.43 
 
 		 278 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  28.94 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  28.51 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.03 
 
 		 278 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  31.4 
 
 		 280 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  31.39 
 
 		 272 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  32.02 
 
 		 276 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.71 
 
 		 278 aa  101  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.39 
 
 		 272 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  31.39 
 
 		 272 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.77 
 
 		 276 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  32.79 
 
 		 323 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  30.34 
 
 		 278 aa  99  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 323 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  32.74 
 
 		 307 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  27.54 
 
 		 304 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  32.38 
 
 		 323 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 302 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.37 
 
 		 282 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>