More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2047 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  100 
 
 
297 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  95.96 
 
 
297 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  47.65 
 
 
312 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  41.88 
 
 
311 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  43.58 
 
 
298 aa  224  9e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  41.38 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  42.07 
 
 
313 aa  195  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  36.49 
 
 
295 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  35.12 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  34.78 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  34.45 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  35.81 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  34.78 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  34.78 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  34.45 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  35.55 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  34.11 
 
 
292 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  34.78 
 
 
292 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  34.11 
 
 
292 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  34.33 
 
 
292 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  34.47 
 
 
290 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  34.48 
 
 
300 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  29.51 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  32.11 
 
 
292 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  33.73 
 
 
283 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  30.56 
 
 
313 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.14 
 
 
319 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.77 
 
 
300 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  32.19 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  32.19 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  26.49 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  28.41 
 
 
321 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  29.45 
 
 
321 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0731  transcriptional regulator/sugar kinase  33.44 
 
 
302 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149546  normal  0.155714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.24 
 
 
299 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.17 
 
 
298 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  30 
 
 
297 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  30.67 
 
 
313 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.59 
 
 
313 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.71 
 
 
315 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  25.66 
 
 
302 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  28.52 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.9 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  27.22 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.85 
 
 
393 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  27.33 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  28.39 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.07 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.77 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  27.33 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.94 
 
 
313 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  30.8 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.79 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.79 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  26.16 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  27.6 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.43 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  25.16 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  27.3 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.52 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.37 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.37 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  24.2 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl013  transcriptional regulator/sugar kinase  31.18 
 
 
305 aa  92  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  28.97 
 
 
404 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.23 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  24.59 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.59 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.15 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.59 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.59 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.59 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.59 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  25.9 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  30.86 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.62 
 
 
396 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0921  transcriptional regulator  29.55 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  24.74 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  26.69 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  25.68 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl616  transcriptional regulator/sugar kinase  24.75 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.04 
 
 
320 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  25.09 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  28.92 
 
 
389 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.84 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  25.5 
 
 
302 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  30.13 
 
 
314 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  27.74 
 
 
332 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.02 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>