49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1897 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  39.26 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  39.26 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  39.69 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  35.42 
 
 		 146 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  34.59 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  33.59 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  28.37 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  27.89 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  31.85 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  33.04 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  30.57 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  30.57 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  28.17 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  29.09 
 
 		 410 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  25.78 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  26.53 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  24.56 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  24.78 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  24.78 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  34.67 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  30.1 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  24.78 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  29.3 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  37.14 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  37.5 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  25.69 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  35.94 
 
 		 423 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  25.49 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  35.94 
 
 		 406 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 461 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  34.38 
 
 		 422 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  35.94 
 
 		 406 aa  40.8  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>