More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1732 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  99.61 
 
 
257 aa  520  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  79.38 
 
 
257 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  78.21 
 
 
257 aa  431  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  78.52 
 
 
272 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  79.38 
 
 
257 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  78.21 
 
 
257 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  80.47 
 
 
256 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  76.26 
 
 
257 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  75.78 
 
 
255 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  76.38 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  75.88 
 
 
259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  76.38 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  76.38 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  76.38 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  75.88 
 
 
259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  75.88 
 
 
259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  75.88 
 
 
259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  76.26 
 
 
259 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  74.61 
 
 
256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  75.88 
 
 
259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  75.98 
 
 
292 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  75.49 
 
 
259 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  74.32 
 
 
259 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  72.76 
 
 
259 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  74.13 
 
 
269 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  71.48 
 
 
260 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  78.21 
 
 
234 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  67.7 
 
 
260 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  65.1 
 
 
255 aa  361  8e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  52.92 
 
 
273 aa  292  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1105  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.61 
 
 
260 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.82 
 
 
257 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  52.54 
 
 
252 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  47.35 
 
 
259 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3813  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4094  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5514999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  51.03 
 
 
252 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  52.32 
 
 
250 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  50.62 
 
 
252 aa  254  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  45.14 
 
 
261 aa  254  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  45.75 
 
 
270 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  48.1 
 
 
256 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0478  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.88 
 
 
238 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  45.8 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  43.75 
 
 
246 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  42.79 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2305  sporulation sigma factor SigF  42.79 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2020  sporulation sigma factor SigF  42.79 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  42.63 
 
 
257 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  42.17 
 
 
249 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1559  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  43.04 
 
 
246 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0615  sigma 28 (flagella/sporulation)  37.83 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1661  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  38.33 
 
 
253 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.691015  normal  0.251698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7708  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  40.27 
 
 
353 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1813  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  39.19 
 
 
258 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0724574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3691  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  40.42 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0974  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  39.5 
 
 
376 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3755  sigma 28 subunit  41.48 
 
 
338 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2905  Sig B/F/G subfamily RNA polymerase sigma-28  40.62 
 
 
259 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.326727  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0559  RNA polymerase sigma factor  41.07 
 
 
267 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3692  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  40.18 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1715  sigma-70 region 2 domain-containing protein  40 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8303  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  40.62 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1358  RNA polymerase, sigma 28 subunit  36.68 
 
 
258 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0455  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.33 
 
 
284 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.333404  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0564  RNA polymerase, sigma 28 subunit  37.22 
 
 
287 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.244424  normal  0.87971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2112  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  37.78 
 
 
360 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3446  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  39.45 
 
 
273 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189666  normal  0.626224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3872  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  35.48 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3793  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  34.26 
 
 
326 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.125919  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5429  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  35.75 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3871  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.98 
 
 
342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0733317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1677  RNA polymerase sigma factor SigB  32.17 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27140  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  36.44 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.967922  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  35.2 
 
 
417 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5399  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.84 
 
 
243 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4789  RNA polymerase sigma factor SigF  33.19 
 
 
262 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2294  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 
374 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2927  RNA polymerase sigma factor SigF  33.03 
 
 
269 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5363  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.3 
 
 
268 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2142  sigma-70 region 2 domain-containing protein  33.03 
 
 
284 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2897  RNA polymerase sigma factor SigF  33.03 
 
 
269 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2941  RNA polymerase sigma factor SigF  33.03 
 
 
269 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1660  RNA polymerase sigma factor SigF  32.88 
 
 
262 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2531  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.84 
 
 
242 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01790  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.38 
 
 
267 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  32.53 
 
 
369 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  33.33 
 
 
361 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1281  RNA polymerase sigma factor SigF  33.92 
 
 
263 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1298  RNA polymerase sigma factor SigF  33.92 
 
 
263 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0930015  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1310  RNA polymerase sigma factor SigF  33.92 
 
 
263 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  32.8 
 
 
358 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>