59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1434 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  844    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  25.6 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 403 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 504 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.62 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  34.78 
 
 		 489 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  38.57 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  38.57 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 774 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 289 aa  47.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 181 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 191 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  29.86 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  27.4 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  30.56 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  29.86 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  30.56 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1238 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  24.64 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  29.86 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.02 
 
 		 991 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  29.86 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  31.25 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  27.4 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  34.69 
 
 		 229 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  34.69 
 
 		 229 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  25.14 
 
 		 206 aa  43.5  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>