94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0643 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  100 
 
 
354 aa  741    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4779  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.58 
 
 
354 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.524787  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4660  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.58 
 
 
354 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4650  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.58 
 
 
354 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.29 
 
 
354 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4743  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.58 
 
 
354 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04059  predicted L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.01 
 
 
354 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04021  hypothetical protein  74.01 
 
 
354 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5708  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.73 
 
 
354 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4722  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.45 
 
 
354 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4663  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.01 
 
 
354 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3821  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.73 
 
 
354 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4752  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.73 
 
 
354 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4436  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.73 
 
 
354 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3801  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.45 
 
 
354 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0133  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.86 
 
 
354 aa  558  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0141  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.86 
 
 
354 aa  558  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000169271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  69.01 
 
 
355 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  68.17 
 
 
355 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0981  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  68.73 
 
 
355 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  61.86 
 
 
353 aa  474  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1998  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.54 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0329  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  57.8 
 
 
372 aa  455  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  58.4 
 
 
363 aa  431  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1805  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.83 
 
 
276 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2540  hypothetical protein  25.84 
 
 
275 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.641788  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3589  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
279 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.83 
 
 
278 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1220  hypothetical protein  25.97 
 
 
284 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000702684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.28 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2496  hypothetical protein  23.88 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  26.01 
 
 
281 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4432  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.73 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0167482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.42 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  22.1 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  22.53 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.16 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  23.94 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.39 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  23.55 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  22.51 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  25.48 
 
 
365 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  25.46 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  25.93 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.39 
 
 
590 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  23.73 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.6 
 
 
385 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.97 
 
 
380 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  21.58 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.08 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.88 
 
 
223 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  23.35 
 
 
214 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.52 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  20.75 
 
 
371 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  24.53 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  25.6 
 
 
396 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  24.1 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.98 
 
 
225 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  22.75 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  22.78 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  27.56 
 
 
350 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  23 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  24.75 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  25.26 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  21.26 
 
 
372 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  25.14 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.35 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  20.81 
 
 
353 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  23.23 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  23.39 
 
 
237 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  26.87 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  25.4 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  22.29 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.45 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  21.82 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  28.83 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  21.81 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  27.84 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  22.22 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  22.22 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  25.62 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  24.12 
 
 
258 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0783  hypothetical protein  22.96 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.02 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  24.86 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  22.01 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  26.98 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.97 
 
 
190 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  23.24 
 
 
353 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0372  hypothetical protein  24.75 
 
 
320 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>