48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0329 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0329  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  100 
 
 		 372 aa  773    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04059  predicted L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.68 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04021  hypothetical protein  59.68 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5708  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.68 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3821  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.68 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4752  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.68 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4436  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.68 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3801  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.41 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4779  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.41 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.524787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4660  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.41 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4650  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.41 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.14 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4743  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.41 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4722  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.14 
 
 		 354 aa  464  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4663  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.41 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  57.8 
 
 		 354 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0141  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  55.11 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000169271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0133  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  55.11 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0981  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  53.08 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  55.59 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  52.55 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  51.6 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  52.42 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1998  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  52.96 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1805  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.01 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2540  hypothetical protein  24.58 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.641788  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.76 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3589  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2496  hypothetical protein  22.98 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1220  hypothetical protein  23.7 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000702684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.5 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  27.36 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  21.99 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4432  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.26 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0167482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  22.75 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.08 
 
 		 590 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  20.83 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  23.83 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  31.78 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.93 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  21.31 
 
 		 277 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  46.2  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  21.58 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  21.7 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  21.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  21.61 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  32.65 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>