More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02900 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  76.15 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  76.15 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  74.62 
 
 		 130 aa  206  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  70 
 
 		 130 aa  195  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  68.46 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  52.31 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  50 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  48.82 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  48.39 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  46.92 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  44.36 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  39.52 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  36.92 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  42.31 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  40 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  39.23 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  41.13 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  39.23 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  38.46 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  31.11 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  33.1 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  33.8 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  32.81 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  32.59 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  31.11 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf428  ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  33.82 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  32.28 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  32.17 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  29.63 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  27.41 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  31.25 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  29.63 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  29.23 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  29.13 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  31.01 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  33.09 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  34.38 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  29.13 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  31.11 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  31.11 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  33.59 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  33.59 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  26.32 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  29.1 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  34.56 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  31.39 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  28.35 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  30.66 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0440  30S ribosomal protein S8  30.08 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106924  hitchhiker  0.0000987465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  28.68 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  31.2 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  30.83 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1182  30S ribosomal protein S8  34.56 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1219  30S ribosomal protein S8  34.56 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  32.39 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  29.41 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0339  ribosomal protein S8  29.41 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  31.2 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  27.91 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1970  30S ribosomal protein S8  33.82 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00042719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  27.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  24.81 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  25.37 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0615  ribosomal protein S8  27.82 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  27.61 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  27.07 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  26.4 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  30.34 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  27.74 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1922  ribosomal protein S8  29.41 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  29.93 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  27.41 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  31.2 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  30.6 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  31.34 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>