33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00880 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  100 
 
 		 490 aa  1014    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  32.53 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  32.23 
 
 		 503 aa  223  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  30.12 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  26.9 
 
 		 376 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  26.43 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  26.9 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  26.19 
 
 		 377 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  27.8 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  25.48 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  25.48 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  25.48 
 
 		 377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  23.42 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  25.57 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  24.73 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  24.29 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  25.9 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  24.6 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  25.59 
 
 		 392 aa  105  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  24.87 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  23.55 
 
 		 438 aa  91.3  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  23.75 
 
 		 377 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  23.76 
 
 		 416 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  23.53 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  23.11 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  23.28 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  24.54 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  28.36 
 
 		 770 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  27.08 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  22.83 
 
 		 476 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  22.18 
 
 		 775 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  28.46 
 
 		 724 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  19.28 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>