46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00720 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  100 
 
 		 132 aa  282  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  57.27 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  47.46 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  49.09 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04219  RNA polymerase III subunit C11, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06380)  48.57 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267157  normal  0.568074 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  40.91 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  37.04 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  37.96 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  34.91 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  36.11 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  36.11 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  34.23 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  37.04 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  33.98 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  32.17 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  32.08 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  46.67 
 
 		 102 aa  57  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  38.18 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  34.29 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  43.55 
 
 		 294 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  34.58 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  28.91 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  32.08 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  56.76 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  33.94 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  31.48 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  31.19 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  52.38 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  32.73 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  53.49 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  31.19 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  28.3 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  30.63 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  48.98 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  48.98 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  48.98 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  47.62 
 
 		 304 aa  47.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  28.04 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  29.52 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  51.28 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  40.43 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36634  predicted protein  45.95 
 
 		 323 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  47.37 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  51.43 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24922  predicted protein  26.79 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>