More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03250 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
367 aa  749    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  59.19 
 
 
367 aa  428  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  55.38 
 
 
368 aa  411  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  53.85 
 
 
410 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  50.4 
 
 
368 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  49.48 
 
 
407 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  48.52 
 
 
367 aa  347  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  49.73 
 
 
378 aa  345  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  47.43 
 
 
367 aa  345  8e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  48.66 
 
 
373 aa  342  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  49.73 
 
 
374 aa  342  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  46.32 
 
 
369 aa  335  7e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  45.48 
 
 
364 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  43.87 
 
 
363 aa  319  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  44.86 
 
 
369 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  44.99 
 
 
369 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  44.77 
 
 
370 aa  311  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  44.72 
 
 
369 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  45.14 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  44.44 
 
 
371 aa  300  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  44.13 
 
 
370 aa  296  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  42.62 
 
 
371 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.62 
 
 
370 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  41.74 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  39.78 
 
 
365 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  41.02 
 
 
368 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  38.34 
 
 
369 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  38.07 
 
 
370 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  38.81 
 
 
346 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  40.44 
 
 
371 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.57 
 
 
389 aa  133  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  28.61 
 
 
387 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  27.39 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  28.34 
 
 
351 aa  123  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  26.61 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  26.16 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.37 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  26.68 
 
 
328 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  26.27 
 
 
357 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  23.8 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  22.71 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.6 
 
 
452 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.83 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  38.52 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  38.52 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  35.09 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.17 
 
 
416 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  34.23 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  36.89 
 
 
437 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  35.09 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  35.09 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  36.07 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  35.09 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  36.26 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  39.17 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  34.43 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  36.07 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  46.51 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  35.56 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.52 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  35.65 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  39.42 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  27.14 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  34.21 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.64 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  31.58 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.19 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  35.59 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  31.58 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.89 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.72 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  24.14 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  38.2 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  34.62 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  33.33 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  36.67 
 
 
432 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  33.9 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.07 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.78 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  39.77 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  35.92 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  32.46 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.45 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  34.78 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  36.96 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  37.93 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  32.62 
 
 
515 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  33.33 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  32.46 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  34.68 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  31.9 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  36.36 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  32.46 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  27.68 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  35.25 
 
 
428 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  28.26 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  35.25 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  33.64 
 
 
356 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  36.07 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  27.88 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>