24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3542 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  733    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 		 756 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 747 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  24.57 
 
 		 797 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  25.09 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  27.85 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 759 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  25.38 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  27.32 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  25.97 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 774 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  23.72 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 761 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  22.22 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 767 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 823 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  20.3 
 
 		 759 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  21.83 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 		 790 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  20.9 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  24.05 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>