More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3225 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3225  dipeptide ABC transporter, permease component  100 
 
 		 351 aa  707    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.57 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.28 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000752871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13493  peptide ABC transporter, permease protein  48.55 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  34.05 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  35.22 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  35.22 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  33.88 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 		 332 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  33.88 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  32.97 
 
 		 336 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  34.95 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  34.95 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  33.79 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  34.42 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  34.25 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  34.15 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  32.69 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  34.14 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  34.14 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  34.14 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  34.14 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  34.14 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  32.69 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  34.07 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  33.24 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  32.69 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  33.88 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.52 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  33.24 
 
 		 336 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.42 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  32.97 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  34.34 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.15 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 		 306 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  32.48 
 
 		 306 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  32.48 
 
 		 306 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  34.08 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  32.48 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.79 
 
 		 335 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 		 335 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.61 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  33.7 
 
 		 336 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  33.52 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  32.19 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 		 309 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  32.38 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.42 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 336 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  35.61 
 
 		 298 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>