More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0850 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0850  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
307 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.86 
 
 
305 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 
308 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
307 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
310 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2888  putative UDP-glucose 4-epimerase  35.68 
 
 
309 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
316 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1847  UDP-glucose 4-epimerase  27.45 
 
 
317 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.336736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
308 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.11 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
333 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
325 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
317 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
314 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
317 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  29.26 
 
 
308 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
315 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
301 aa  119  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.39 
 
 
298 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
316 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
317 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
309 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
327 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
318 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
308 aa  115  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  31.35 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.97 
 
 
327 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
331 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
311 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
336 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
322 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
328 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
342 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
328 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  30.23 
 
 
337 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  26.93 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  28 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  29.53 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.52 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  28.33 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.73 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
306 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
349 aa  109  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.69 
 
 
334 aa  109  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.45 
 
 
307 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
340 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
324 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.71 
 
 
325 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
296 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
336 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
324 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
292 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
346 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
332 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
334 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  30.93 
 
 
328 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
341 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
328 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.93 
 
 
325 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
332 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  27.74 
 
 
321 aa  105  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
324 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
327 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
314 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000109546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
324 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  26.09 
 
 
323 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
292 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  27.97 
 
 
331 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.6 
 
 
337 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
331 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  25.87 
 
 
323 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
342 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
327 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
341 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
325 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
353 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
340 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
342 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.45 
 
 
340 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>