255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1015 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  58.5 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  56.46 
 
 
147 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  53.06 
 
 
143 aa  157  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  51.02 
 
 
147 aa  152  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  51.03 
 
 
146 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  53.42 
 
 
147 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  53.42 
 
 
147 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  44.83 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  43.17 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  43.17 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  39.04 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  39.58 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  38.89 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  38.51 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  38.51 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  36.73 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  40.54 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  37.59 
 
 
151 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.73 
 
 
149 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  39.86 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  38.06 
 
 
149 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.36 
 
 
149 aa  104  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  37.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36.3 
 
 
150 aa  104  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  37.67 
 
 
148 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  37.67 
 
 
148 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  35.86 
 
 
149 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  40.79 
 
 
157 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.62 
 
 
148 aa  103  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  41.33 
 
 
513 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.85 
 
 
156 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  39.86 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  37.31 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  37.59 
 
 
149 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  35.33 
 
 
151 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  36.05 
 
 
147 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  33.56 
 
 
147 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  35.53 
 
 
153 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 
147 aa  100  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  34.01 
 
 
148 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  36.73 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  34.69 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  36.05 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.31 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
148 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  35.57 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  34.01 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  37.16 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  37.16 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  37.84 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  37.16 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  34.93 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.31 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  41.35 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.55 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  35.57 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  36.49 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  35.37 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.57 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  34.48 
 
 
149 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  34.25 
 
 
147 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  37.58 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  36.05 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  36.57 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  42.19 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  37.5 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  34.93 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  33.81 
 
 
148 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  34.9 
 
 
152 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  34.93 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  34.44 
 
 
151 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>