35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0800 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  64.16 
 
 
455 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  100 
 
 
461 aa  968    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  60.34 
 
 
456 aa  598  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  38.19 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  38.29 
 
 
473 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  38.33 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  37.56 
 
 
488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  36.88 
 
 
488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  36.79 
 
 
464 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  36.34 
 
 
505 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  36.63 
 
 
489 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  36.47 
 
 
487 aa  256  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  33.92 
 
 
529 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  32.43 
 
 
535 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  33.19 
 
 
528 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  28.27 
 
 
520 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  29.67 
 
 
496 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  27.48 
 
 
511 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  28.47 
 
 
407 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  26.76 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  26.53 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  27.56 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  27.33 
 
 
442 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  25.81 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  23.86 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  25.05 
 
 
425 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  23.42 
 
 
418 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  24.08 
 
 
580 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  25.26 
 
 
570 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  25.26 
 
 
570 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  25.26 
 
 
570 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  24.63 
 
 
559 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  24.16 
 
 
658 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  23.64 
 
 
577 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
266 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>