More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0726 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  50 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  42.26 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  42.26 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  42.26 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  46.15 
 
 		 291 aa  222  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  47.64 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  42.38 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  47.88 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  43.02 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  42.91 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  47.49 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  42.01 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  41.64 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  47.49 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  40.52 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  47.49 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  41.7 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  45.02 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  39.03 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  42.38 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  46.46 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  48.03 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  38.89 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  40 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  39.26 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  39.26 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  41.48 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  41.57 
 
 		 281 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  40.3 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  41.42 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  37.78 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  41.8 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.73 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  40.62 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  43.35 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.11 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.11 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.11 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.11 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  40.23 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.11 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  37.08 
 
 		 287 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  37.27 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  37.08 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  39.38 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  39.7 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  37.83 
 
 		 285 aa  181  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.61 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.61 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  38.43 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.61 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.61 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.61 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  40.77 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  43.68 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  38.06 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  38.61 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  38.61 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  38.61 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  40.77 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0246  ABC-3 protein  40.77 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  37.27 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  40.78 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  39.62 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  37.08 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  38.61 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  40 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  37.25 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  36.53 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.94 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0724  AfeC  37.45 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.251948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  38.06 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  40.6 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  36.98 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  37.26 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  37.26 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  36.72 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  36.72 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  37.26 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  39.69 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  36.84 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  37.59 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 280 aa  161  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  38.37 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  38.12 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  41.67 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  38.12 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.67 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  35.93 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.52 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.31 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>