More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1928 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1928  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.495016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  57.68 
 
 
249 aa  281  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  49.8 
 
 
260 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 
244 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
244 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 
244 aa  258  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
244 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.65 
 
 
250 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
244 aa  257  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  53.09 
 
 
265 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
244 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  55.23 
 
 
245 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
244 aa  255  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  47.58 
 
 
260 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 
244 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 
244 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  50.83 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  48.36 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  49.8 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  51.44 
 
 
253 aa  252  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  51.03 
 
 
253 aa  252  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.59 
 
 
300 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 
263 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  53.33 
 
 
241 aa  251  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  47.6 
 
 
263 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.07 
 
 
249 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 
252 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 
252 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 
244 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  49.37 
 
 
243 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 
252 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  49 
 
 
264 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.83 
 
 
250 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 
253 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 
253 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  50 
 
 
250 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50 
 
 
250 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  51.02 
 
 
253 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.92 
 
 
240 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51.25 
 
 
240 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
253 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
253 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 
250 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  50.62 
 
 
242 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52.74 
 
 
240 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 
250 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  47.56 
 
 
271 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.38 
 
 
247 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
251 aa  244  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 
240 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50 
 
 
250 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  50.63 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  47.97 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  51.03 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.44 
 
 
263 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  46.47 
 
 
245 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  49.58 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  49.58 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
241 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  51.25 
 
 
245 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  49.8 
 
 
253 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  49.18 
 
 
255 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  50.62 
 
 
266 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  50.21 
 
 
260 aa  241  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 
253 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  50.63 
 
 
243 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
240 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  49.17 
 
 
248 aa  240  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  48.75 
 
 
247 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>