More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1062 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  82.32 
 
 		 425 aa  709    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  837    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  61.52 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  56.48 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  50.85 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  50.48 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  49.15 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  47.94 
 
 		 390 aa  335  7e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  47.68 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  34.81 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  33.42 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  33.25 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  32.12 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  29.98 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  31.31 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  38.87 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  37.4 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  29.88 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  33.62 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  30.6 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  27.15 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  27.15 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  27.15 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  25.57 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  25.56 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  25.66 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  26.87 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  26.27 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  24.59 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  24.21 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  25.66 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  22.1 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  26.69 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  25.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  25.17 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  25.31 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  25.31 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  22.22 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  25.5 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  25.31 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  25.31 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  24.63 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5054  histidine kinase  25.42 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  23.95 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 563 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  25.31 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.75 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  25.71 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  24.05 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  27.53 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  22.99 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  25.1 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>