More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08471 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  77.88 
 
 		 537 aa  881    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  69.53 
 
 		 538 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  59.51 
 
 		 539 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  66.73 
 
 		 550 aa  769    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59 
 
 		 541 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  66.67 
 
 		 554 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  57.17 
 
 		 569 aa  658    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.19 
 
 		 534 aa  657    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.3 
 
 		 534 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  56.61 
 
 		 597 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0090  CTP synthetase  55.2 
 
 		 569 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.49 
 
 		 535 aa  652    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  57.01 
 
 		 565 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  67.47 
 
 		 565 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.13 
 
 		 542 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  56.88 
 
 		 564 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  55.6 
 
 		 531 aa  637    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  100 
 
 		 539 aa  1116    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  68.79 
 
 		 539 aa  776    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.58 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.58 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  78.03 
 
 		 539 aa  875    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.1 
 
 		 542 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  62.52 
 
 		 563 aa  706    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  56.88 
 
 		 565 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  56.36 
 
 		 533 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  58.18 
 
 		 565 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.95 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.68 
 
 		 535 aa  631  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  55.6 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  55.22 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.12 
 
 		 532 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  55.2 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.11 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.11 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.8 
 
 		 537 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  55.7 
 
 		 536 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.11 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  55.08 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  57.52 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  54.9 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  54.26 
 
 		 548 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.9 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  55.12 
 
 		 538 aa  624  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  52.34 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  53.7 
 
 		 531 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  54.29 
 
 		 533 aa  618  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.87 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  57.79 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.25 
 
 		 534 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  53.6 
 
 		 530 aa  618  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53.99 
 
 		 558 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  54.82 
 
 		 551 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  51.87 
 
 		 544 aa  620  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  57.71 
 
 		 533 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  55.51 
 
 		 538 aa  619  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  52.34 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  52.91 
 
 		 535 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  55.6 
 
 		 554 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  53.43 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  55.83 
 
 		 534 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  53.89 
 
 		 547 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  54.19 
 
 		 536 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  52.45 
 
 		 559 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  53.3 
 
 		 543 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  55.04 
 
 		 542 aa  609  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  53.12 
 
 		 534 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  53.2 
 
 		 555 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  54.16 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  53.14 
 
 		 544 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  53.78 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  53.3 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  53.69 
 
 		 544 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  52.53 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  53.51 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  53.26 
 
 		 538 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  53.93 
 
 		 544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  53.38 
 
 		 534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  53.51 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  53.3 
 
 		 555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.07 
 
 		 558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  53.32 
 
 		 550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  52.65 
 
 		 547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  52.08 
 
 		 547 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  53.16 
 
 		 542 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  52.92 
 
 		 543 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  53.93 
 
 		 544 aa  600  1e-170  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  55.35 
 
 		 542 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  53.56 
 
 		 546 aa  598  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  54.17 
 
 		 546 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  55.06 
 
 		 546 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  53.01 
 
 		 534 aa  598  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  53.6 
 
 		 542 aa  601  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  52.93 
 
 		 534 aa  601  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>