30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04110 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  100 
 
 		 877 aa  1800    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  36.36 
 
 		 881 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  36.5 
 
 		 892 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  33.22 
 
 		 936 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  27.86 
 
 		 824 aa  344  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  25.85 
 
 		 873 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  26.29 
 
 		 873 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  26 
 
 		 868 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  26.09 
 
 		 872 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  27.22 
 
 		 841 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  29.78 
 
 		 808 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  27.29 
 
 		 810 aa  216  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  29.55 
 
 		 735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  28.72 
 
 		 741 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  31.48 
 
 		 778 aa  142  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  29.49 
 
 		 803 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  26.59 
 
 		 735 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  28.28 
 
 		 725 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  29.89 
 
 		 793 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  29.94 
 
 		 799 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  29.65 
 
 		 799 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  31.79 
 
 		 788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  29.36 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  29.47 
 
 		 785 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  27.92 
 
 		 790 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  25.08 
 
 		 761 aa  97.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  27.41 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  26.79 
 
 		 1120 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  26.46 
 
 		 356 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  23.86 
 
 		 236 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>