35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1258 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  30.19 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  35.29 
 
 		 815 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 		 830 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  35.05 
 
 		 830 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 		 750 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  36.84 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 		 814 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3022  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 681 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5115  glycosyl transferase family 51  35.85 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  30.58 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.1 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  35.79 
 
 		 810 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 845 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  30.34 
 
 		 290 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  35.35 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  35.35 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  32.11 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  35.35 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 		 1348 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.36 
 
 		 1656 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2554  hypothetical protein  29.03 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.85 
 
 		 1363 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  20.54 
 
 		 1016 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  20.54 
 
 		 1016 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  26.79 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  28.3 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  24.84 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  33.33 
 
 		 797 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.47 
 
 		 825 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  27.1 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  27.1 
 
 		 358 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>