83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0383 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  100 
 
 
115 aa  226  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  43.21 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  38.74 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  39.47 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  37.39 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  38.53 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  37.38 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  40.66 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  40.66 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  37.38 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  37.38 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  46.67 
 
 
222 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  45.33 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  45.33 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  45.33 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  45.33 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  45.33 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  45.33 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  45.33 
 
 
294 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  37.36 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  38.89 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  41.67 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  40.23 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  35.51 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  30.28 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  41.67 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  39.47 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  44.12 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  44.12 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  34.55 
 
 
120 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  33.02 
 
 
139 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  42.17 
 
 
129 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  38.96 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  32.32 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  35.29 
 
 
200 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  39.47 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  38.18 
 
 
121 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  37.27 
 
 
121 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  38.1 
 
 
136 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  37.27 
 
 
121 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  38.1 
 
 
136 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  38.1 
 
 
136 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  37.27 
 
 
121 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  38.33 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  32.14 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  37.7 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  37.7 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  38.18 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  38.18 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  28.74 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  38.18 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  31.33 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 
447 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  38.18 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  28.74 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  31.53 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  34.15 
 
 
265 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  34.62 
 
 
266 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  33.8 
 
 
190 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  33.8 
 
 
190 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  34.62 
 
 
266 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  29.55 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  34.62 
 
 
266 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1936  putative phospholipid-binding liporotein  31.2 
 
 
191 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00720124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  34.62 
 
 
256 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  34.62 
 
 
266 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  34.62 
 
 
256 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  34.62 
 
 
266 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  35.9 
 
 
189 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0257  lipoprotein  31.2 
 
 
191 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  40.32 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  40.32 
 
 
246 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  40 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  31.46 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  39.34 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  40.32 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.98 
 
 
204 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.98 
 
 
204 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.98 
 
 
204 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  31.88 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  32.93 
 
 
265 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1805  transport-associated protein  29.06 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000477327  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  32.93 
 
 
265 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>