28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3822 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  540  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  85 
 
 
269 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  65.25 
 
 
261 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  63.57 
 
 
259 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  63.18 
 
 
259 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  57.95 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  57.95 
 
 
272 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  40.73 
 
 
279 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  41.6 
 
 
261 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  41.22 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  40.84 
 
 
261 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  44.27 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  42.06 
 
 
248 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  43.13 
 
 
277 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  38.61 
 
 
243 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  36.8 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  40.31 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  36.17 
 
 
249 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  37.78 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  43.59 
 
 
152 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  41.03 
 
 
131 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  32.08 
 
 
123 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  35.56 
 
 
130 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  37.33 
 
 
119 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  25.55 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  32.91 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  30.08 
 
 
286 aa  42  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>