More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1885 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0154  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.48 
 
 
670 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19740  ATP synthase F1, alpha subunit  69.68 
 
 
513 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0130  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.48 
 
 
670 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1122  ATP synthase F1, alpha subunit  69.48 
 
 
525 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1048  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.63 
 
 
664 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0426  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.71 
 
 
556 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2779  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.26 
 
 
504 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.470369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1885  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
510 aa  1002    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879266  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0043  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.85 
 
 
530 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2787  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.63 
 
 
670 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.48 
 
 
670 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2645  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.63 
 
 
666 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.727067  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5553  F0F1 ATP synthase subunit alpha  80.51 
 
 
522 aa  796    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1050  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 
517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4103  ATP synthase F1, alpha subunit  63.14 
 
 
497 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0134913  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3935  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  62.93 
 
 
497 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455536  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.42 
 
 
503 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.45 
 
 
504 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.32 
 
 
502 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.38 
 
 
510 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.02 
 
 
502 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.02 
 
 
502 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.93 
 
 
502 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  51.89 
 
 
541 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.4 
 
 
503 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.78 
 
 
508 aa  448  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.71 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2707  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.83 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.555137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.12 
 
 
571 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.61 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.61 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.37 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.84 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  53.21 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.65 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.36 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.81 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.61 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  50.71 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.61 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.89 
 
 
504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.26 
 
 
501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.9 
 
 
503 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.07 
 
 
505 aa  444  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  51.42 
 
 
508 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.61 
 
 
502 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.52 
 
 
506 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.46 
 
 
505 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  52.51 
 
 
508 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.36 
 
 
503 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.91 
 
 
505 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.26 
 
 
519 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  53.1 
 
 
585 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.34 
 
 
505 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  48.67 
 
 
512 aa  443  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.93 
 
 
528 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.38 
 
 
509 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  47.75 
 
 
507 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.18 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.46 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.02 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.18 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.95 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.9 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.59 
 
 
504 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.68 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.83 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.9 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.9 
 
 
522 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.79 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
522 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.66 
 
 
505 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.59 
 
 
502 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.83 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.07 
 
 
505 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.59 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.83 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.78 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.43 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  49.16 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.83 
 
 
505 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.98 
 
 
517 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 
505 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.71 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 
505 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.77 
 
 
517 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  50 
 
 
504 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.12 
 
 
525 aa  438  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  51.06 
 
 
507 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.59 
 
 
520 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.12 
 
 
505 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>