More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0805 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 358 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  83.89 
 
 		 365 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  74.25 
 
 		 369 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  74.1 
 
 		 363 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 		 371 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  67.89 
 
 		 368 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  66.86 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  66.3 
 
 		 370 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  68.17 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  64.59 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  61.23 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  56.9 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  56.51 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  56.23 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  55.88 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  55.88 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  54.71 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  54.71 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  53.82 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  56.18 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  56.18 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  54.71 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  54.41 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  54.41 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  54.41 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  54.41 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  55 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  54.41 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  54.41 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  45.74 
 
 		 368 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  46.31 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 		 365 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  47.29 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  47.29 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  39.06 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.9 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.09 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 349 aa  196  7e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.48 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 348 aa  189  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  32.89 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.38 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.35 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.43 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  32.21 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.07 
 
 		 373 aa  162  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2316  histidinol-phosphate aminotransferase  34.3 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 		 368 aa  155  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  34.68 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1030  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  33.65 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>