68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7328 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  100 
 
 
197 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  67.35 
 
 
196 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  65.31 
 
 
196 aa  278  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  62.64 
 
 
277 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  57.8 
 
 
275 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  59.2 
 
 
277 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  58.38 
 
 
274 aa  220  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  54.91 
 
 
276 aa  220  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  58.05 
 
 
277 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  54.34 
 
 
276 aa  218  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  54.91 
 
 
276 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  53.76 
 
 
276 aa  218  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  57.23 
 
 
275 aa  217  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  56.07 
 
 
275 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  56.07 
 
 
274 aa  215  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  55.49 
 
 
275 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  56.32 
 
 
275 aa  212  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  56.32 
 
 
275 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  57.23 
 
 
275 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  57.8 
 
 
275 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  57.47 
 
 
275 aa  208  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  56.65 
 
 
273 aa  207  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  55.49 
 
 
274 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  53.76 
 
 
274 aa  204  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  58.38 
 
 
275 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  54.34 
 
 
274 aa  197  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  54.34 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  54.34 
 
 
274 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  54.34 
 
 
274 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  54.34 
 
 
274 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  58.38 
 
 
274 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  56.07 
 
 
275 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  56.65 
 
 
275 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  51.41 
 
 
278 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  50.9 
 
 
273 aa  184  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  50.3 
 
 
272 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  49.13 
 
 
273 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  52.05 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  51.7 
 
 
287 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  52.02 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  45.93 
 
 
273 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  49.42 
 
 
295 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  53.76 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  46.47 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  52.1 
 
 
273 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  46.47 
 
 
273 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  49.12 
 
 
273 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  45.36 
 
 
281 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  46.47 
 
 
273 aa  158  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  46.89 
 
 
287 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  45.88 
 
 
272 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  44.71 
 
 
272 aa  154  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  44.12 
 
 
315 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  44.12 
 
 
272 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  44.71 
 
 
272 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  46.86 
 
 
316 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  43.75 
 
 
312 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  44.12 
 
 
272 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  44.12 
 
 
273 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  44.12 
 
 
273 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  44.12 
 
 
272 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  43.53 
 
 
272 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  43.53 
 
 
272 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  40.46 
 
 
266 aa  143  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  42.22 
 
 
295 aa  140  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  30.95 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  28.99 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  29.38 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>