226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5297 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5297  AFG1-family ATPase  100 
 
 
367 aa  745    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  34.78 
 
 
371 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  35.01 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.23 
 
 
365 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  35.31 
 
 
365 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  35.47 
 
 
365 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  36.73 
 
 
366 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  36.03 
 
 
365 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  34.36 
 
 
365 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  34.97 
 
 
365 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  35.65 
 
 
365 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  34.36 
 
 
365 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  35.07 
 
 
367 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  35.16 
 
 
365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  34.36 
 
 
365 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  36.25 
 
 
367 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  34.36 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  34.36 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  34.36 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  34.49 
 
 
371 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  34.88 
 
 
365 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  35.67 
 
 
365 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  35.92 
 
 
367 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  34.01 
 
 
365 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  34.69 
 
 
360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  36.96 
 
 
356 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  33.53 
 
 
365 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  34.38 
 
 
366 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  32.17 
 
 
377 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  33.53 
 
 
366 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  33.53 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  35.17 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  35.17 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  33.24 
 
 
366 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  33.24 
 
 
366 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  33.24 
 
 
366 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  33.24 
 
 
366 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  33.24 
 
 
365 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  32.96 
 
 
375 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  32.96 
 
 
375 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  35.63 
 
 
371 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  32.96 
 
 
375 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  33.56 
 
 
371 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  37.12 
 
 
343 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2352  AFG1-family ATPase  34.42 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  34.91 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3343  AFG1 family ATPase  34.43 
 
 
357 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  33.01 
 
 
339 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  33.82 
 
 
365 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  34.38 
 
 
372 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  34.2 
 
 
367 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  31.58 
 
 
364 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  31.58 
 
 
364 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  31.58 
 
 
364 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  33.66 
 
 
393 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  33.73 
 
 
361 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  34.23 
 
 
367 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  32.9 
 
 
367 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  34.21 
 
 
404 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  35.83 
 
 
376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2586  hypothetical protein  31.23 
 
 
360 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  33 
 
 
364 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  33.23 
 
 
390 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34230  hypothetical protein  31.06 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0422054  decreased coverage  0.00436044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  31.87 
 
 
364 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  34.52 
 
 
376 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  32.33 
 
 
364 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  35.94 
 
 
394 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  32.56 
 
 
366 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  31.84 
 
 
373 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  32.19 
 
 
383 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  32.44 
 
 
360 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  32.39 
 
 
382 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  31.38 
 
 
364 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  33.23 
 
 
360 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2359  AFG1-family ATPase  31.73 
 
 
358 aa  160  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  32.91 
 
 
364 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  32.91 
 
 
364 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  31.09 
 
 
374 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  32.23 
 
 
365 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  32.85 
 
 
368 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  30.58 
 
 
384 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  32.24 
 
 
397 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  32.43 
 
 
391 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  30.64 
 
 
367 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  31.4 
 
 
368 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  33.11 
 
 
368 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  31.62 
 
 
383 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  30.86 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  31.44 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  30.86 
 
 
381 aa  156  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  32.69 
 
 
372 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  30.79 
 
 
367 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.36 
 
 
375 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  32.36 
 
 
375 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  32.36 
 
 
375 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  32.36 
 
 
375 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  32.44 
 
 
367 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  31.15 
 
 
393 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  31.21 
 
 
386 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>