53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3306 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 311 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  97.73 
 
 		 309 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  79.94 
 
 		 309 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  65.48 
 
 		 310 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  65.48 
 
 		 310 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  65.48 
 
 		 310 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  65.48 
 
 		 310 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  65.48 
 
 		 310 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  65.48 
 
 		 310 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  65.16 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  62.83 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  61.51 
 
 		 308 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  35.02 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  34.92 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  31.15 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  35.22 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  32.67 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  32.34 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  34.62 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  31.79 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  30.1 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  31 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  31.13 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  31.13 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  26.32 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  29.96 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  29.81 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  29.59 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  29.96 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  32.76 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  29.96 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  30.41 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  36.7 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  32.35 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  29.07 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  26.92 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  26.92 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  26.92 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  26.92 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  26.92 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  28.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  26.54 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  27.97 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  26.54 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>