185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6351 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6351  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.514037  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  49.42 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.79 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.87 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.24 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.72 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  35.29 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  35.29 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  34.38 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  34.38 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  34.38 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.95 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.21 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  22.98 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  33.07 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.9 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.39 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.39 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.39 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  23.45 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.72 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.35 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  22.98 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.75 
 
 		 350 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.53 
 
 		 341 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.81 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  22.47 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.07 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.58 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  23.97 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.18 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.71 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.04 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  23.97 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  30.57 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  29.58 
 
 		 569 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.92 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  36.44 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.89 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  23.89 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  23.68 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  24.07 
 
 		 614 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  25.67 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  26.07 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  23.45 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  25.53 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 562 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  26.21 
 
 		 544 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.88 
 
 		 395 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 		 364 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.34 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 364 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  22.83 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 567 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.29 
 
 		 556 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 356 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.91 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.33 
 
 		 386 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  33.61 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  28.36 
 
 		 567 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  25.61 
 
 		 564 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  24.57 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 666 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  26.78 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  27.96 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  21.11 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.13 
 
 		 541 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.72 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.45 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.72 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 		 583 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  28.36 
 
 		 568 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  28.37 
 
 		 572 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  28.49 
 
 		 569 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  27.5 
 
 		 355 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 		 346 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  22.77 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 		 676 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 		 676 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 664 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2566  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.73 
 
 		 332 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29.92 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.35 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  27.03 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  26.7 
 
 		 561 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.74 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>