More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4777 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  340  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0164  competence/damage-inducible protein CinA  68.45 
 
 		 173 aa  237  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  52.47 
 
 		 259 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2276  CinA domain-containing protein  51.52 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906635  hitchhiker  0.00967543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47070  CinA-related protein  52.8 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.797955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  50.66 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  48.68 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  47.71 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  43.4 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  45.91 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  45.28 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  43.04 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  43.31 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  41.14 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  42.07 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  41.46 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  40.85 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  43.87 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 429 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  45.86 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  43.23 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  46.04 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  45.39 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  41.1 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  41.1 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  43.84 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  45.39 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  39.35 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  45.14 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  45.39 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  46.04 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  41.03 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  43.97 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  42.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  41.94 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  46.36 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  44.6 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  44.67 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  42.48 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  43.67 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  41.1 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  42.55 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  34.62 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  40.65 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  41.78 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  41.83 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  41.83 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  41.83 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  43.15 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  43.75 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  41.22 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  43.83 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  34.12 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  42.31 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  46.43 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  44.16 
 
 		 422 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  46.51 
 
 		 203 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  44.22 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  42.25 
 
 		 430 aa  92  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.82 
 
 		 414 aa  92  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  38.71 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  44.44 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  42.11 
 
 		 430 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  41.56 
 
 		 211 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  41.06 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  41.06 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  41.94 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  45.89 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  41.56 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  37.5 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  45.89 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  42.21 
 
 		 208 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  35.71 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  42.14 
 
 		 418 aa  87.8  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  40.26 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  40.26 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  38 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  42.21 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>