More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0449 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0449  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  58.76 
 
 		 297 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1358  transcriptional regulator, LysR family  54.64 
 
 		 296 aa  344  8.999999999999999e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1975  transcriptional regulator, LysR family  51.53 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18090  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  37.5 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1189  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.544335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27230  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0943  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07300  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.52 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.52 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.18 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.18 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.18 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.18 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.85 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.52 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  21.81 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4550  transcriptional regulator, LysR family  24.84 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.597489  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  23.45 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6369  transcriptional regulator, LysR family  24.51 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  23.79 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  24.66 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  32.88 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4467  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0400691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  28.29 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  24.07 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1417  LysR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 336 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  23.39 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  23.39 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2742  DNA-binding transcriptional regulator CynR  22.41 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0588637  normal  0.665335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3231  LysR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  25.08 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  26.18 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1200  DNA-binding transcriptional regulator CynR  25.17 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  33.79 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.18 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  25.59 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4318  LysR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.772143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 375 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2431  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>