More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3658 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  80.92 
 
 		 133 aa  216  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  77.86 
 
 		 133 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  77.86 
 
 		 133 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  77.44 
 
 		 137 aa  204  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  77.86 
 
 		 150 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  76.34 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  76.34 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  76.34 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  75.57 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  72.18 
 
 		 138 aa  199  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  72.18 
 
 		 138 aa  199  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  76.56 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  72.18 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  72.18 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  79.51 
 
 		 136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  71.97 
 
 		 135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  71.43 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  74.81 
 
 		 132 aa  196  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  73.48 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  69.92 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  79.49 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  67.67 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  79.49 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  68.66 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  76.86 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  69.47 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  69.23 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.09 
 
 		 128 aa  184  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  69.47 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  67.42 
 
 		 347 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  75 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  63.85 
 
 		 334 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  63.33 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  55.3 
 
 		 138 aa  156  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  48.33 
 
 		 312 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  46.34 
 
 		 318 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  48.36 
 
 		 313 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  43.85 
 
 		 316 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  47.54 
 
 		 315 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  43.44 
 
 		 329 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  39.84 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.3 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.35 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  46.72 
 
 		 314 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  46.72 
 
 		 314 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  44.44 
 
 		 317 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  45.31 
 
 		 400 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.9 
 
 		 315 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40.48 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  45.9 
 
 		 314 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.9 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  42.97 
 
 		 352 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  47.06 
 
 		 383 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.44 
 
 		 316 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.27 
 
 		 317 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  45.08 
 
 		 314 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.79 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.55 
 
 		 306 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.31 
 
 		 310 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.62 
 
 		 316 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  40.16 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.19 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.91 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.79 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.79 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.79 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.71 
 
 		 360 aa  90.9  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.8 
 
 		 314 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  38.46 
 
 		 314 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.91 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  41.41 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.04 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.84 
 
 		 386 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.19 
 
 		 329 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.19 
 
 		 329 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 		 363 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.9 
 
 		 313 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.64 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>