38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0051 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  100 
 
 
859 aa  1705    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  49.94 
 
 
909 aa  735    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  43.47 
 
 
873 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  43.38 
 
 
878 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  37.81 
 
 
888 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  38.86 
 
 
850 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  40.88 
 
 
851 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  40.93 
 
 
828 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  40.67 
 
 
844 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  39.52 
 
 
846 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  37.66 
 
 
850 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  43.87 
 
 
910 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  43.29 
 
 
879 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  43.28 
 
 
908 aa  446  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  37.88 
 
 
866 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  44.35 
 
 
914 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  34.71 
 
 
881 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  34.59 
 
 
881 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  33.37 
 
 
862 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  32.24 
 
 
897 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  34 
 
 
832 aa  336  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  30.9 
 
 
805 aa  335  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  31.93 
 
 
897 aa  324  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  32.96 
 
 
884 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  32.5 
 
 
884 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  29.7 
 
 
914 aa  287  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  31.77 
 
 
834 aa  280  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  30.91 
 
 
834 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  31.27 
 
 
830 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  32.56 
 
 
867 aa  266  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  30.11 
 
 
850 aa  239  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  28.34 
 
 
883 aa  234  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  30.5 
 
 
834 aa  223  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  29.47 
 
 
904 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  28.78 
 
 
963 aa  128  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.29 
 
 
767 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  34.46 
 
 
894 aa  57.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  25.64 
 
 
2993 aa  49.3  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>