More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  646    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  40.43 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  45.37 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  40.61 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  43 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  50.91 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  43.9 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  42.93 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  41.09 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  46.99 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  43.96 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  46.99 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  43.98 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  45.9 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  43.98 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  39.17 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  39.32 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  47.31 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  41.04 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  40.62 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  35.49 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  37.84 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  39.16 
 
 		 358 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  37.74 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.42 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  36.6 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.02 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  30.48 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06350  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.752661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  27.19 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  34.51 
 
 		 337 aa  86.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.36 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  42.76 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  33.33 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  34.3 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1423  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.9 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  27.15 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.92 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.9 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.9 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.9 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  39.86 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.9 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.63 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.55 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  40.99 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0386  transcriptional regulator, LacI family  31.28 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.55 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  36 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.24 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2155  LacI family transcription regulator  27 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.3 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  36.91 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  36.91 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.3 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1956  transcriptional regulator, LacI family  37.82 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.1 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  26.25 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.61 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  36.3 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0354  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  31.18 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  31.18 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  38.36 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  37.57 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  37.61 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  29.19 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  41.78 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  28.26 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>