98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  100 
 
 		 97 aa  199  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  55.26 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  58.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  66.13 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  64.52 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  48.15 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  59.68 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  59.68 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  53.95 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  50 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  47.87 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  51.39 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  52.63 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  42.5 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  50.7 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  52.63 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  53.23 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  51.56 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  58.49 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  51.52 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  49.23 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  54.84 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  49.21 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  50.82 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  52.46 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  48.94 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  37.18 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  41.03 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  51.06 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  47.27 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  51.06 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  37.14 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  38.57 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  38.03 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  38.16 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  51.16 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  31.82 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  31.82 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  40.58 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  37.66 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  58.62 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  48 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  36.76 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  58.06 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  40 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  42.55 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  60 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  42 
 
 		 118 aa  42  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  40 
 
 		 123 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  40 
 
 		 213 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  42 
 
 		 106 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  40 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  39.66 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  40 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  41.27 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  39.66 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  58.06 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  36.49 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  35.19 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  40 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  37.84 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  44 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  40 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  40 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  40 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  42 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  40 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 93 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  37.84 
 
 		 83 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  40 
 
 		 108 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>