More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 
495 aa  1016    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.35 
 
 
491 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  49.69 
 
 
491 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.69 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.44 
 
 
467 aa  353  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  36.73 
 
 
489 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  38.19 
 
 
467 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  37.86 
 
 
467 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  38.38 
 
 
472 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  37.5 
 
 
478 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.26 
 
 
472 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.77 
 
 
481 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  31.76 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
502 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  30.55 
 
 
486 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 
490 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 
486 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  30.25 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  29.71 
 
 
486 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  29.22 
 
 
483 aa  221  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  30.28 
 
 
485 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 
486 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
532 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.22 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.45 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.3 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 
547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.94 
 
 
492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 
486 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 
486 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  29.09 
 
 
555 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 
484 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 
486 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  30.57 
 
 
492 aa  211  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.1 
 
 
485 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  31.77 
 
 
471 aa  210  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  31.34 
 
 
475 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
491 aa  208  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
486 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
486 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  29.67 
 
 
485 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  29.73 
 
 
486 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  34.11 
 
 
481 aa  206  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  29.55 
 
 
479 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  28.84 
 
 
479 aa  204  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.49 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  28 
 
 
514 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 
484 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  29.3 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.21 
 
 
514 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.85 
 
 
490 aa  200  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  30.51 
 
 
484 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
505 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.38 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 
514 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.39 
 
 
483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.94 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  29.8 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 
484 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  30.42 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  28.21 
 
 
514 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
518 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.39 
 
 
514 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  28.78 
 
 
479 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.7 
 
 
482 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  33.86 
 
 
481 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
485 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  28.91 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  28.54 
 
 
505 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  28.54 
 
 
505 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  27.94 
 
 
480 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  27.8 
 
 
479 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  29.1 
 
 
479 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.15 
 
 
509 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.04 
 
 
541 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.35 
 
 
509 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.25 
 
 
509 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.1 
 
 
485 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
474 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1331  phospholipase D/transphosphatidylase  26.9 
 
 
519 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000112238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>