47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  100 
 
 		 260 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.23 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.44 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.74 
 
 		 291 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  43.63 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.89 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.91 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.25 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.92 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.75 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  35.32 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  35.78 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.08 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  38.65 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.75 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.78 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.48 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  31.97 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  32.37 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  33.52 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.5 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.85 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.98 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  25.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1963  hypothetical protein  26.54 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  25.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  25.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  32.1 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.43 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.1 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  45.45 
 
 		 191 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  45.45 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>