More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
316 aa  623  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.39 
 
 
329 aa  332  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0879036  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.01 
 
 
330 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
308 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.03308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
339 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.781515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1104  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.69 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204963  normal  0.0432036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.69 
 
 
323 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0243999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
298 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9092  trehalose/maltose transport inner membrane protein  32.07 
 
 
326 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309735  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
303 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7724  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 
312 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
331 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.618019  normal  0.983661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
337 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
332 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
337 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
310 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
310 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  29.9 
 
 
310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 
310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
310 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 
310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  30.18 
 
 
310 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
296 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
312 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  29.55 
 
 
310 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  29.55 
 
 
310 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  29.9 
 
 
310 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 
296 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
312 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
315 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
309 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
311 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
334 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
299 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.9 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.511569  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
294 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
292 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
307 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.45 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
316 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
314 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  28.24 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.270526 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
294 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  27.91 
 
 
294 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
294 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
291 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
313 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 
299 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.235202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
291 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
305 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
310 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
309 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.72 
 
 
304 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
337 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  28.52 
 
 
312 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
293 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
311 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
301 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.88 
 
 
300 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
319 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
342 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01288  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.9 
 
 
293 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01299  hypothetical protein  27.9 
 
 
293 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
293 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71913  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
323 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1426  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
293 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
304 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
293 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102296  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0749  sugar ABC transporter, permease protein, putative  26.3 
 
 
289 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1811  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
293 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0699  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 
289 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.383075  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1521  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
293 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1956  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
293 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.798746  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  29.58 
 
 
305 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
306 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  30.29 
 
 
322 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
319 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  0.167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
299 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
294 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288658  normal  0.0756683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
311 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
436 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
291 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.37 
 
 
308 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.42 
 
 
321 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
308 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  26.67 
 
 
318 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
262 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
306 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
313 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>